溶剂可及性（三）DSSP和biopython

发布于 2022-07-24

关于DSSP的安装教程有很多，方式也不尽相同，这里我介绍一种个人觉得最便利的方法，通过anaconda安装相关库： conda i …

溶剂可及性（二）Protein Data Bank

发布于 2022-07-24

一、Protein Data Bank 蛋白质数据库（Protein Data Bank，简称PDB）是一个专门收录蛋白质及核酸的 …

发布于 2022-07-24

一、基本概念溶剂可及性（solvent accessibility）一般描述为可及表面积（access surface ar …

发布于 2022-05-06

一、BLAST+下载在ncbi官网下载压缩包：https://ftp.ncbi.nlm.nih.gov/blast/execut …

发布于 2022-04-29

POSSUM 网站一共给出了21种PSSM的”变形“，这21种”变形“出自13篇不同的论文，我简单阅读这13篇论文，对各个PSSM …

发布于 2022-04-29

最近应导师要求，需要在POSSUM网站上生成氨基酸序列对应的21种以PSSM为基础的特征，博主本身从未接触过PSSM，因此想记 …

发布于 2022-03-31

一、DIAMOND安装 DIAMOND用于序列比对，速度比BLAST快不少，安装也比较方便，这里介绍两种安装方式。 Linux命令 …